Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIP4K2AP48426 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms