Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRXP46100 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms