Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATA4P43694 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA4P43694 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms