Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms