Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms