Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP2P42575 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP2P42575 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms