Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5CP41229 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms