Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LTBRP36941 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms