Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms