Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA1P35221 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA1P35221 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA1P35221 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTNNA1P35221 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA1P35221 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms