Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms