Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms