Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTKP29376 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTKP29376 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTKP29376 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTKP29376 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTKP29376 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTKP29376 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTKP29376 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTKP29376 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTKP29376 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTKP29376 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms