Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms