Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms