Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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