Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms