Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD33P20138 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD33P20138 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms