Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms