Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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