Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms