Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC130P13994 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms