Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms