Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX6A1P12074 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms