Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP1P11387 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms