Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GLI4P10075 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms