Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI2P10070 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI2P10070 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI2P10070 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI2P10070 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms