Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBSLP0DN79 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBSLP0DN79 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms