Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP10P09238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms