Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMBP08949 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBP08949 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBP08949 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBP08949 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBP08949 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms