Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFLP07196 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFLP07196 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFLP07196 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFLP07196 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFLP07196 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms