Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZBED1O96006 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms