Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN9O95484 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms