Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVILO95425 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SVILO95425 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVILO95425 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVILO95425 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms