Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms