Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM2O94769 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM2O94769 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM2O94769 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM2O94769 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM2O94769 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM2O94769 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM2O94769 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM2O94769 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms