Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms