Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRY3O43610 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms