Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF3O43395 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms