Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms