Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms