Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms