Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM223BA6NKX1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms