Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms