Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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