Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
C4orf17Q53FE4 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C4orf17Q53FE4 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms