Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms