Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SH3BP1Q9Y3L3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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