Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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