Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC85BQ15834 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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